総務係
部内の総合調整、経理事務
管理係
港湾関係業務、都市計画及び都市計画事業の総合調整、都市計画に係る制限の確認及び許可等、長崎市都市計画審議会の事務局、住居表示の実施、国土法の届出の土地利用調査
計画係
都市計画の基礎調査に関する業務、都市計画決定に関する調査、企画、土地利用計画及び都市施設に係る調査、企画、地区計画
地籍調査係
地籍調査業務(一筆ごとの土地について、その所有者、地番及び地目の調査並びに境界(筆界)の確認及び地積の測量を行い、その結果を地籍図及び地籍簿として作成する)
市街地整備係
市街地再開発事業、土地区画整理事業(長崎駅周辺地区・東長崎地区以外)、都市再生、まちづくり活動団体への支援、斜面市街地再生事業(計画関係)